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Hiroshima City University 
Graduate School of Information Sciences 
Dept. of Biomedical Information Sciences 

Specially Appointed Assistant Professor 
Hiroko X. Kondo 

Papers
Research paper (scientific journal)  Joint  Structural basis for the membrane association of ankyrinG via palmitoylation  Yuichiro Fujiwara†,*, Hiroko X. Kondo†, Matsuyuki Shirota, Megumi Kobayashi, Kohei Takeshita, Atsushi Nakagawa, Yasushi Okamura, and Kengo Kinoshita* † These authors contributed equally to this work.  Scientific Reports  6, 23981-  2016/04 
Research paper (scientific journal)  Free-energy landscapes of protein domain movements upon ligand binding  Hiroko X. Kondo, Noriaki Okimoto*, Gentaro Morimoto, and Makoto Taiji  The Journal of Physical Chemistry B  115/ 23, 7629-7636  2011/06 
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Research presentations
Oral presentation(invited, special)  Molecular dynamics simulations of the effect of zinc on the voltage‐gated proton channel VSOP  第53回日本生物物理学会年会  2015/09 
Oral presentation(invited, special)  エンハンスドサンプリング手法を用いたタンパク質の構造サンプリング  統計数理研究所研究会 シミュレーション科学と統計科学の間(統計数理研究所共同研究「シミュレーション科学と統計科学の対話」主催)  2013/03 
Poster presentation  Improvement of sampling efficiency through combined use of molecular dynamics simulations with implicit and explicit solvent models  Biophysical Society 57th Annual Meeting  2013/02 
Oral presentation(invited, special)  Computational analysis of the conformational changes in proteins  第12回 日本バイオインフォマティクス学会創薬インフォマティクス研究会「タンパク質-リガンド相互作用:分子シミュレーションおよび合成展開からのアプローチ」  2010/07 
Oral presentation(invited, special)  分子動力学シミュレーションによるタンパク質構造変化の解析  公開シンポジウム「蛋白質の基質結合や構造変化における分子揺らぎの意義を討論する会」(新学術領域研究「揺らぎが機能を決める生命分子の科学」共催)  2010/03 
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Prizes
Bioinfo 2009 CBI-KSBSB Joint Conference Best Poster Award  2009/11 
研究科長賞(修士)  2009/03 
バイオスーパーコンピューティングシンポジウム2008 ポスター賞  2008/12 
第22回分子シミュレーション討論会 学生優秀発表賞  2008/11 
21世紀COEジュニア・アワード  2008/11 
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